73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0777 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  68.15 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  68.15 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  68.15 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  57.89 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  41.43 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  44.93 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  41.43 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  36.81 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  37.76 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  37.59 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  36.43 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  36.17 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.29 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.71 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  31.79 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  33.11 
 
 		 239 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  29.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  32.64 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  36.69 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  32.61 
 
 		 316 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  29.63 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.68 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.6 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  32.62 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  27.66 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.47 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  26.28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  27.74 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  31.25 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  26.32 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  34.74 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  31.51 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  31.65 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  27.41 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  32.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  32.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  32.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  32.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  20.65 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  32.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  25.66 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  31.51 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  40.62 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>