73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4580 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 157 aa  319  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  43.54 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  43.15 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  39.6 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  42.38 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  39.16 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  42.42 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  34.09 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  35.37 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  33.11 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  33.8 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  33.1 
 
 		 172 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  31.94 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  36.05 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  35.88 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  28.15 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  35.77 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  31.34 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  29.25 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  31.85 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.45 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  25.76 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  34.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  32.86 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  31.76 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  26.24 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  29.13 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  29.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  29.79 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  34.29 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  30.56 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  31.36 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  26.57 
 
 		 191 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 190 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  30.16 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 198 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  31.43 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  29.84 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>