64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1000 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  40.48 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  41.06 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  39.87 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  39.74 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  36.31 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  37.84 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  41.01 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  41.01 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  41.01 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  39.72 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  37.59 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  35.42 
 
 		 316 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  35.57 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 237 aa  80.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  35.85 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  29.22 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  34.91 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  28.15 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  29.8 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  33.79 
 
 		 244 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.39 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  24.31 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  29.19 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  29.81 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  26.42 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  23.78 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  30.28 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25.16 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  23.29 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  24.38 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  24.16 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.8 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  27.78 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  23.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  28.06 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  28.37 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  22.6 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  21.05 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  28.21 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  21.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  29.63 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  29.32 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  28.68 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  27.21 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  28.68 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  27.91 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  27.41 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  27.41 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>