75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2558 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  49.65 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  46.58 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  44.14 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  41.3 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  38.85 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 237 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  39.01 
 
 		 232 aa  87.8  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  34.91 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  40.15 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  38.17 
 
 		 316 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  33.81 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  35.97 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  34.23 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  36.69 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  35.42 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 268 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.72 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.85 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  34.51 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  32.86 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  29.94 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  34.56 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  29.41 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  24.09 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  30.56 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  26.53 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  26.43 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  36.59 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  21.71 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  31.34 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  31.34 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  28.45 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  30.6 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  31.78 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  30.12 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.41 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  28 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  32.05 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  27.1 
 
 		 187 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  28.92 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  30.95 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  33.71 
 
 		 201 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  26.28 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  26.28 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  25.27 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  21.02 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  32.31 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  28.48 
 
 		 213 aa  40.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  23.03 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>