30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02225 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  41.06 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.79 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  28.1 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  33.72 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  30.2 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  29.71 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  25.69 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  27.27 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  24.47 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  28.97 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  25.71 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  31.91 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  30 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  24.03 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  25.29 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 		 174 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  31.76 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  19.72 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>