79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4631 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  72.53 
 
 		 218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  76.1 
 
 		 174 aa  254  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  66.09 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  56.98 
 
 		 181 aa  210  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  55.68 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  55.68 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  56.98 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  56.98 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  56.98 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  56.98 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  47.83 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  50.88 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  51.98 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  50.83 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  47.83 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  46.2 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  45.03 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  45.03 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  49.71 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  48.65 
 
 		 192 aa  170  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  48.65 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  49.71 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  48 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  43.1 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  42.39 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  48.5 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  47.62 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  46.59 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  40.94 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  47.67 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  45.35 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  38.46 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  37.63 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  38.95 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  36.15 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  41.74 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  36.3 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  35.58 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  28.57 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  32.69 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.41 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  34.57 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  28.77 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  24.74 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  30.12 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  35.87 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  27.89 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  21.1 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  29.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  27.66 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  18.92 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  32.14 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  34.29 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  22.12 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  23.28 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  23.28 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  34.55 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  28.82 
 
 		 288 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  34.67 
 
 		 152 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  26.61 
 
 		 152 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>