59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2135 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 145 aa  149  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  32.18 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 192 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  41.05 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  32.14 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  27.96 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  31.76 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  36.62 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  35.21 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  35.21 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  34.62 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  29.35 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  35.21 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  34.72 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  32.39 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  24.83 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  28.79 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  30.65 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  30.85 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  28.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  30.99 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  27.86 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  29.89 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  30.38 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  30.99 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  26.06 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  26.06 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  30.26 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  33.8 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  26.85 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  32.88 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  25.35 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  25.35 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  25.35 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  25.35 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  31.51 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.13 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  24.83 
 
 		 218 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  27.85 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  30.82 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>