79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2572 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  66.67 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  66.67 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  69.54 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  69.54 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  69.54 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  69.41 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  69.54 
 
 		 213 aa  247  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 193 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  64.53 
 
 		 192 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  61.76 
 
 		 194 aa  237  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  71.35 
 
 		 198 aa  234  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  59.67 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  60.59 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  61.99 
 
 		 192 aa  230  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  61.99 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  59.12 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  60.26 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  52.3 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  57.39 
 
 		 187 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  51.15 
 
 		 187 aa  194  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  50 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  45.98 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  48.48 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  48.48 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  48.48 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  48.48 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  48.48 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  48.48 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  46.15 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  43.79 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  41.97 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  42.94 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  41.92 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  39.78 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  40.8 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  39.08 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  37.78 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  34.67 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  44.66 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  39.83 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  37.59 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  36.75 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  36.75 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  30.15 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  25.79 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  33.93 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  34.21 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  37.8 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  44.83 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  36.9 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  25.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  21.95 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  28.06 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  34.48 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  27.38 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  29.51 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  34.52 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.01 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  23.53 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  24.14 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  27.97 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.45 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  26.83 
 
 		 153 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  27.96 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>