80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0589 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  100 
 
 
175 aa  352  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  44.58 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  43.98 
 
 
186 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  39.42 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  40.25 
 
 
174 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  36.72 
 
 
189 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
168 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  41.96 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  42.03 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  46.9 
 
 
186 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  40.56 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  41.32 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  41.13 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  36.3 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  38.57 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  36.76 
 
 
191 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  39.39 
 
 
183 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  37.87 
 
 
217 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  38.3 
 
 
194 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  39.26 
 
 
186 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  36.5 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  36.5 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  36.5 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  36.5 
 
 
177 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  36.5 
 
 
177 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 
190 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  36.5 
 
 
177 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 
174 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  39.1 
 
 
186 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  42.31 
 
 
213 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  39.1 
 
 
186 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  36.69 
 
 
207 aa  101  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  37.69 
 
 
178 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  36.23 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  44.34 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  36.03 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  43.22 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  38.93 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  38.93 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  41.91 
 
 
191 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  33.09 
 
 
187 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  29.24 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  32.45 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  34.04 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  33.06 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  32.53 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  27.83 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  29.41 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  31.33 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  28.43 
 
 
187 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  28.43 
 
 
187 aa  50.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  24.76 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  28.87 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  37.88 
 
 
198 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  28.42 
 
 
175 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  31.47 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  38.82 
 
 
150 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  30.99 
 
 
179 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.97 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  33.8 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  33.78 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  31.03 
 
 
180 aa  44.3  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  29.2 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.15 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  36.14 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>