54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1475 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  52.63 
 
 
187 aa  174  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  49.43 
 
 
187 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  49.43 
 
 
187 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  41.04 
 
 
183 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  40 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 
178 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  31.25 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  27.91 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
190 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  25.31 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  25.9 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  25.31 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  25.9 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  25.31 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  25.18 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  23.78 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  21.8 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  23.33 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  23.33 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  23.33 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  23.02 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  25.42 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  23.02 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  28.72 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  23.02 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  30.34 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  22.73 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  21.97 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  21.97 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  20.14 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  21.97 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  21.97 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  21.97 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  24.14 
 
 
168 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  22.12 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  19.48 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  23.53 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  25.93 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  24.46 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  21.43 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  26.47 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  23.36 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  21.43 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>