62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1942 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  71.26 
 
 		 201 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  72.53 
 
 		 186 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  75.29 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  58.72 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  54.24 
 
 		 181 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  42.72 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  42.86 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 174 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  46.11 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  46.84 
 
 		 190 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  45.76 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  47.4 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  47.4 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  42.69 
 
 		 186 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  42.19 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  41.36 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  44.83 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  39.8 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  40.35 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  40.35 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  44.86 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  45.83 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  44.79 
 
 		 192 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  41.54 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  37.5 
 
 		 191 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  42.61 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  38.07 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  36.42 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  34.68 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  40.16 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  37.69 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  34.03 
 
 		 167 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  36.92 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  36.19 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  25.3 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  25.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  34.72 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  25 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  19.15 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  24.68 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  29.79 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  26.14 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  19.27 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.41 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 145 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 309 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>