75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6122 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  96.35 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  74.46 
 
 		 194 aa  305  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  73.91 
 
 		 194 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  68.75 
 
 		 192 aa  277  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  73.81 
 
 		 178 aa  276  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  70 
 
 		 190 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  68.28 
 
 		 191 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  64.25 
 
 		 217 aa  254  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  63.69 
 
 		 207 aa  250  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  63.59 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  60.75 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  60.75 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  60.75 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  59.07 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  57.61 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 198 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  44.44 
 
 		 191 aa  200  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  47.49 
 
 		 181 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  48.86 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  45.4 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  45.4 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  45.4 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  45.4 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  45.4 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  44.83 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  48.65 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  48.55 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  44.79 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  41.57 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  40.78 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  38.59 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  40.22 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  36.42 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  40.56 
 
 		 175 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  41.46 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  32.08 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  34.23 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  34.23 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  32.69 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  28.19 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  29.19 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  24.11 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  34.52 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  36.47 
 
 		 169 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  32.5 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.57 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  25.17 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  31.76 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.5 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  32.26 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  27.78 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  24 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  30.34 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  30.95 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  32.93 
 
 		 150 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>