47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5635 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  376  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  59.44 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  56.94 
 
 		 150 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  49.31 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  47.48 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  39.74 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  41.73 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  44.14 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  44.3 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  40.14 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  34.9 
 
 		 152 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 237 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  36.43 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  39.29 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  30.46 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  41.22 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  29.25 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  26.9 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.8 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  24.59 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  28.38 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  25.6 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  30.34 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  31.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  30.68 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  29.76 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  25.17 
 
 		 163 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  25.17 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  36.62 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>