80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7088 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  47.02 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  45.88 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  43.24 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  41.09 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  42.31 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  40.32 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  41.54 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  41.54 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  41.54 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  40.16 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  39.04 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  39.86 
 
 		 217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  43.36 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  43.48 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  38.76 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  41.74 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  39.44 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  40.18 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  34.23 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  39.53 
 
 		 207 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  36 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  40.87 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  40 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  33.11 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  41.96 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 181 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 198 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  31.29 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  36.94 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  31.43 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  22 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  27.66 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.03 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  27.62 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  31.11 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  23.88 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  30.23 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  36.62 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  25.71 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  25.71 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  25.4 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  32.86 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.28 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  31.03 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  21.77 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  34.48 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  26.62 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  21.54 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  30.56 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>