38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2806 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  41.06 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  30.2 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.17 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  24.14 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  37.07 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  29.33 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  26.57 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  25.85 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  25 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  20.98 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  23.62 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  26.11 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  30.56 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  23.72 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  24.6 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  20 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  25.69 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  23.29 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  26.28 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  22.63 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  23.78 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  27.81 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  30.7 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  25.6 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  22.67 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  26.62 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  21.43 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  18.75 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>