81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4698 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  57.89 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  58.78 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  58.78 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  58.78 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  41.73 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  41.91 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  37.68 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  43.36 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  39.72 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  34.9 
 
 		 193 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  34.04 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  33.8 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  32.21 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.89 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  28.03 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  30.2 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  33.81 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  27.66 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  33.6 
 
 		 316 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  31.16 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  30.88 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  30.66 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  29.09 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.06 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  27.54 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.08 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  30.08 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  31.5 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  31.21 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.69 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  30.07 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.76 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 268 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  43.75 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  29.17 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  37.33 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  31.2 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  27.42 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  23.58 
 
 		 184 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  32.86 
 
 		 191 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  34.67 
 
 		 186 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  30.99 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  26.61 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  27.78 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 174 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>