48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0102 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  41.96 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  43.84 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  41.26 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  41.91 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  37.84 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  38.85 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  33.57 
 
 		 232 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  34.33 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  34.53 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  32.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.34 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  26.21 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 251 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  25.5 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  27.52 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  27.59 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.14 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  22.63 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  28.35 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  23.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  24.11 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  25.87 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  22.97 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  26.55 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  23.62 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  32.86 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  27.97 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  31.43 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>