34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10692 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  35.17 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  42.42 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  37.32 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  32.89 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  31.39 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  35.53 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  35.85 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  31.79 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  25.41 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  32.82 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  32.82 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  32.82 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  34.34 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.82 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30.08 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  20 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  23.91 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  25.87 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  25.4 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  21.85 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  24.5 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  38.71 
 
 		 156 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  25.17 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>