12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10078 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  37.07 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  34.18 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  32.56 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  33.72 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  27.47 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  23.91 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  26.24 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.46 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  26.58 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>