69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3656 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  52 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  48.3 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  35.67 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  32.47 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  35.88 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  32.8 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30.2 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  31.01 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  27.87 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.33 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  30.13 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  27.45 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  33.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  33.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  33.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  27.39 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  25.5 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  28 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  27.81 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  33.09 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  30.71 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  25.69 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  35.48 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  34.94 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  34.94 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  23.88 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  28.39 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  30.49 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  35.48 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  25.47 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  30.15 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  31.15 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  28.38 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  26.4 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.47 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.57 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.47 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  32.26 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  27.94 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  27.92 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  24.03 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  34.15 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  30.26 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 251 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  31.17 
 
 		 184 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 198 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  24 
 
 		 189 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  31.15 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  28.77 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 237 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  23.91 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>