87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2190 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  68.53 
 
 		 153 aa  193  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  60.14 
 
 		 152 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  45.33 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  42.66 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  44.67 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  39.73 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  43.45 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  41.83 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  40.27 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  35.34 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  38.3 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  33.33 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.5 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  40.15 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  28.19 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  32.19 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  34.07 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  34.88 
 
 		 316 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  31.11 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.86 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  30.92 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  31.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25.78 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.6 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  31.39 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  28.37 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  36.88 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  25.6 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  29.61 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  27.46 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  23.94 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  33.57 
 
 		 244 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  46.48 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  46.48 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 253 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  52.08 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  52.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  34.72 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 268 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  26.25 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  29.69 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  29.69 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  36.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  23.74 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  31.82 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  32.93 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  31.08 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  31.62 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  31.78 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  24.49 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  27.21 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  30.84 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  33.64 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  32.71 
 
 		 192 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  30.56 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>