43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0969 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  59.87 
 
 		 159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.99 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  33.08 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  28.28 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  27.27 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  24.29 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  27.14 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  24.11 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  24.66 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  25.49 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.87 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  24.18 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  25.33 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.35 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  22.7 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  34.88 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  26.39 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  27.12 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  28.46 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  31.65 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  33.72 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.65 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  36.14 
 
 		 316 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.96 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  28.97 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  30.56 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  29.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  26.9 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  24.79 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>