70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2926 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 163 aa  323  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  53.85 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  48.3 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  36.42 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  33.56 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  29.77 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  30.37 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  26.45 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  31.03 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  30.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  30.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  30.6 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  20.98 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  22.97 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  29.66 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  27.21 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  29.35 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  27.66 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  32.17 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  41.05 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  31.47 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  31.47 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  31.47 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  26.9 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  26.57 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  34.58 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  22.6 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  29.08 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  30.5 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  30.1 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2975  hypothetical protein  25.85 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  26.28 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  29.08 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 253 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  35.37 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  26.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  34.12 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  24.66 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  28.38 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  29.85 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  25.2 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  28.38 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  27.52 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  24.41 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  28.19 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  30.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  26.9 
 
 		 186 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  30 
 
 		 156 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  25.17 
 
 		 193 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 181 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>