78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4898 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 185 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  68.51 
 
 		 186 aa  254  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  68.51 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  67.96 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  50.29 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0198  transcriptional regulators-like  50 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4796  transcriptional regulators-like protein  50 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5338  transcriptional regulators-like protein  50 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  50 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  50 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  50 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  46.59 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1942  transcriptional regulator-like protein  44.83 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368597  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  46.06 
 
 		 201 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  42.2 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  40.94 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  42.69 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  42.94 
 
 		 213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  38.83 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  42.11 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  42.11 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  40.94 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  39.18 
 
 		 207 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  38.59 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  38.8 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1483  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  42.42 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  38.01 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  38.95 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  34.5 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  32.94 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  39.04 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  31.76 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  32.92 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  30.26 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  32.33 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  32.33 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  32.31 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  29.36 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  29 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  29.03 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  30.93 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2636  hypothetical protein  25.61 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2690  hypothetical protein  25.61 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  25 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  30.3 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  31.46 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  30.28 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.11 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  35.53 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1475  YuaC  28.72 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.472023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  29.1 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  43.14 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.57 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.68 
 
 		 251 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  28.92 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  25.33 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  24.03 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  24 
 
 		 179 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>