25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0691 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0691  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  35.87 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0066  hypothetical protein  28.36 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.165023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  28.95 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  39.62 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  39.62 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  36 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  30.67 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  30.67 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  29.33 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  30.67 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  32.81 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>