111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3680 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  63.71 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  51.96 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  47.79 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  46.85 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  42.98 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  44.07 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  40.83 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  43.59 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  42.15 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  46.02 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  41.9 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  41.9 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  40.32 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  43.1 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.95 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  47.67 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  38.89 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  39.83 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  34.71 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  35.96 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  38.82 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  37.39 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  31.93 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  37.72 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  31.09 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  30.43 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  32.95 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  35.23 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  27.12 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  30.4 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  29.41 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  36.47 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  36.94 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  29.76 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  25.42 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.35 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  30.83 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  22.76 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  34.85 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  37.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>