164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2641 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  37.5 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  39.09 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  31.67 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  41.59 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  33.64 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  36.13 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  36.54 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  36.89 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  31.58 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  30.17 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  48.48 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  45.59 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  38.79 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  28.07 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  31.9 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  32.5 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  32 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  35.78 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  32.43 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  45.12 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  34.17 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  38.67 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  38.67 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  29.82 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  30.91 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  27.19 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  37.72 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  30.36 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  24.8 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  28.45 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  27.59 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  28.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  26.5 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  41.67 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  35.35 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  23.28 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  35.83 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  23.89 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  24.59 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  35.59 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  24.59 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  34.15 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>