79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0182 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 139 aa  193  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  61.87 
 
 		 139 aa  190  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  62.32 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  62.32 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  58.99 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.15 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  37.33 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  37.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  29.55 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  39.19 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  38.16 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  28.71 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  27.34 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  24.17 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  23.66 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  24.43 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  28.32 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  31.48 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  35.21 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  34.67 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  34.67 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  28.45 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  38.75 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  28.32 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  24.8 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  23.81 
 
 		 125 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 127 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  27.43 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 127 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  38.1 
 
 		 129 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  27.88 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  30.99 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  32.93 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  32.86 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>