86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0782 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 124 aa  258  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  61.48 
 
 		 124 aa  170  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  52.03 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  43.9 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  40.34 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  42.61 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  42.11 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  36.97 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  37.17 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  38.26 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  35.96 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  34.48 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  36.45 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  33.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  28.07 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  29.91 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  33.93 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.78 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.78 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  26.98 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  36.63 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  26.61 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  30.97 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  26.98 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  26.98 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  26.96 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  26.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  25.41 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  23.21 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  31.82 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  31.82 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.23 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  28.57 
 
 		 139 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  30.12 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  29.2 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  17.39 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  25.23 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  23.58 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  27.72 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25.6 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.42 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  24.78 
 
 		 126 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>