97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2588 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 169 aa  349  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  52.17 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  43.33 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  48.78 
 
 		 124 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  43.94 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  44.27 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  43.94 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  43.94 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  44.7 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  44.7 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  44.26 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  42.15 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  42.15 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  41.74 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 121 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  38.26 
 
 		 124 aa  90.5  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  34.43 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 126 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  35.25 
 
 		 126 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  31.67 
 
 		 128 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  34.82 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  32.5 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  32.2 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  31.58 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  30.7 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 125 aa  72  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  33.63 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  33.05 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  30.7 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  27.87 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  30 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  32.48 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  41.9 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  24.37 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  31.86 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  29.82 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.56 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  25.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  22.88 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  24.62 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.8 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 129 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  24.14 
 
 		 127 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  24 
 
 		 124 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 123 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  23.89 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  25.62 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  27.05 
 
 		 119 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  20.51 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  31.34 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  20 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  18.25 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 130 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  26.09 
 
 		 123 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  31.46 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  21.85 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>