83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3211 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  44.92 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  45.61 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  42.24 
 
 		 124 aa  120  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  41.38 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  42.24 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  43.1 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  43.97 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  40.17 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  33.63 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  36.75 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  35.29 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  32.17 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  33.02 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  33.7 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  27.83 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.98 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  35.11 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  29.06 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  30.28 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  25.23 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  28.44 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  28.44 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  25.62 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  27.35 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  24.79 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  31 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  29.31 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  30.28 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.61 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  23.14 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  21.85 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  25.96 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  23.64 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  22.88 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  27.72 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  28.44 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  18.1 
 
 		 122 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  21.74 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  22.41 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  28.21 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  29.27 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>