97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3882 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  41.67 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  36.67 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  38.26 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  40.35 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  36.84 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  36.84 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  35.09 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  35.09 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  35.09 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  33.62 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  32.46 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  32.77 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  27.59 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  27.59 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  26.55 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  26.55 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  28.32 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  27.43 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  26.96 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  32.17 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  29.09 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  27.83 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  23.93 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  23.64 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.1 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  28.87 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  24.35 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  23.68 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  22.81 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  32.65 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  34.78 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  30.25 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  24.17 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.36 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  25.74 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  27.05 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  22.61 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  40.79 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  28.07 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  21.85 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  22.02 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  29.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  28.1 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  21.01 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  20.91 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  27.12 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  21.05 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  19.3 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  23.68 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  23.48 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  23.48 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  37.7 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  23.48 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  23.48 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  25.23 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  21.24 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 135 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>