102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07786 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  65.57 
 
 		 124 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  61.34 
 
 		 123 aa  161  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  43.7 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  45.95 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  39.83 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  37.39 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  35.29 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  37.17 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  31.9 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  32.17 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  29.46 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  32.54 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  33.61 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  32.03 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  33.61 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  27.19 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  26.67 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  32.48 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  32.54 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  30.17 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  26.72 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  31.62 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.52 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  31.62 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  29.47 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  24.8 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  28.32 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  26.56 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  29.67 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  29.67 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  25.83 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  27.43 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  32.5 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  28.95 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  29.07 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  28.95 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  24.79 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  28.32 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  28.57 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.42 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  25.66 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  27.84 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  24.78 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  22.03 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  24.14 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  26.36 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  27.19 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  21.49 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  22.86 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  26.5 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  23.85 
 
 		 155 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 117 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  23.01 
 
 		 130 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  29.25 
 
 		 107 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26.27 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  21.26 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  24.32 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  23.58 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  23.58 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  26.56 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25.2 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>