125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3296 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  41.53 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  38.71 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  33.05 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  35.09 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  38.98 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  35.96 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  34.43 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  34.78 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  33.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  35.04 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  31.67 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  33.04 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  33.63 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  32.77 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  32.17 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  27.42 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  32.17 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  31.9 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  30.77 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  33.64 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  31.36 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  27.43 
 
 		 121 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  30.7 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  22.81 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.32 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  32 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  26.55 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  29.51 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  25.64 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  26.32 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  30.09 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  31.68 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  28.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  26.61 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  31.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  37.5 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.89 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  37.35 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  37.35 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  21.31 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  26.32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  25.44 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  31.01 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  42.25 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  33.04 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  21.31 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.35 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>