111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3766 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 116 aa  226  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  58.41 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  51.61 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  56.48 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  54.87 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  54.63 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  52.29 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  49.11 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  53.51 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  51.69 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  50.88 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  49.11 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  48.72 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  51.79 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  48.51 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  45.61 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  44.64 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  44.64 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  51.49 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  48.21 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.18 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  41.82 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  39.45 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  41.07 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  43.14 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  43.7 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  38.05 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  40.37 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  40.7 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  45.54 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  43.75 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  34.78 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  35.78 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  30.7 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  40.3 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  30.77 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  41.03 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  27.38 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  32.18 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  30.28 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  22.03 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  31.03 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  31.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  36.25 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  40.28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  27.68 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.93 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  33.75 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  35.45 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.36 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  24.27 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  39.39 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>