51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5280 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  291  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  57.02 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  47.79 
 
 		 114 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  39.34 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  48.05 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  42.31 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  36.79 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  31.96 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  32.43 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  31.71 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  36.14 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  33.61 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  34.95 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  40.32 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  27.52 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  34.31 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  32.43 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  32.79 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  39.8 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  28.57 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  28.57 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 166 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  28.95 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  33.77 
 
 		 127 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>