66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0967 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  43.75 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  46.23 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  46.02 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  44.92 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  39.45 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  41.23 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  40.37 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  40.68 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  36.61 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  39.17 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  37.82 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  37.61 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7010  CopY family transcriptional regulator  42.11 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  39.32 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  37.04 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  37.61 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  38.53 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  37.27 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 
129 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  32.17 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  36.52 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  68.75 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  33.6 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  29.57 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  29.57 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  34.95 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  36.44 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  36.54 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  33.98 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  32.35 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.44 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  30.7 
 
 
139 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  27.83 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  26.96 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  35.58 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  30.17 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32.76 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32.76 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  30.09 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  26.09 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  35.35 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  32.43 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  30.83 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  37.8 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  27.03 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  27.03 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  27.03 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  34.67 
 
 
139 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  30.91 
 
 
127 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  31.53 
 
 
128 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  30.91 
 
 
127 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>