122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3357 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  93.48 
 
 		 138 aa  225  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  85.71 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  89.86 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  89.86 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  89.86 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  74.8 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  70.73 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  57.5 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  54.92 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  57.14 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  52.1 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  49.62 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  55.08 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  53.39 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  53.57 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  49.17 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  46.72 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  43.7 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  46.85 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 182 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  35.83 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  44.63 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  43.97 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  41.38 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  39.66 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40.17 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  39.82 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  37.07 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  39.84 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  39.02 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  39.02 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  43.44 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  41.58 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  42.19 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  35.09 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  31.01 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  33.71 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  31.86 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  38.75 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  35.54 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  31.09 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  33.6 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  31.45 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  33.04 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  33.98 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  37.31 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  34.45 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  34.12 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  28.69 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  44.44 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  34.96 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  28.69 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  37.19 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  28.69 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  31.76 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  39.76 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2483  transcriptional repressor, CopY family  41.58 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.481913  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  30.67 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>