102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4098 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  290  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  54.1 
 
 
135 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  53.17 
 
 
205 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  43.09 
 
 
125 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  51.26 
 
 
133 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  42.28 
 
 
125 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  43.52 
 
 
128 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  36.07 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  39.32 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  41.07 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  35 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  34.17 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  37.84 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  42.05 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  34.88 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  34.88 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  35.54 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.54 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  40.74 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  34.17 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  34.17 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  34.17 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  36.11 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  36.47 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  39.81 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  37.37 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  37.37 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  37.37 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  37.37 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  34.26 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  34 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  35.54 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  36.36 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  40.48 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  34 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  36.59 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  31.54 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  34.15 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  29.03 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  35.16 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  37.93 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  31.4 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  25.21 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  25.21 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  36.08 
 
 
126 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  36.08 
 
 
126 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 
142 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  35 
 
 
131 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  24.62 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  23 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  24.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  26.72 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  32.31 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  28.69 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  24.73 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.67 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  27.91 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  35.06 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  23.36 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  28.7 
 
 
122 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  38.46 
 
 
129 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  32.29 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  23.7 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  32.93 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  25.29 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  32.67 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  31.76 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  31.75 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.83 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  23.4 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  31.25 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  25 
 
 
121 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  25.27 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  20.43 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  21.67 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  25.61 
 
 
130 aa  40  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.325229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>