72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1351 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  100 
 
 		 128 aa  258  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  43.8 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  44.17 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  45 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  43.33 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  39.67 
 
 		 205 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  29 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  31.97 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  29.6 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  29.6 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  30.53 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  30.61 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  30.93 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  30.93 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  28.83 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  28 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  23.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  30.26 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  32.94 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  29.17 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  27.03 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  27.85 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  26.92 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>