102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0290 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  53.39 
 
 		 205 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  46.22 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  47.54 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  46.22 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  42.86 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  42.34 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  34.19 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  31.93 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  40.74 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  36.29 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  40.26 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  29.41 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  33.61 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  33.91 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  39.51 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  25.22 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  21.95 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  21.14 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  25.22 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  20.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  20.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  20.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  20.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  20.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  30.65 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  32.04 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  33.77 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  38.75 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  38.75 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  36.36 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  35.53 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  24.79 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.82 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  27.48 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  27.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  27.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  30.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  35.45 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  23.16 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  24 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  33.77 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  27.5 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  32.71 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  22.11 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25 
 
 		 131 aa  42  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  23.16 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  18.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  27.14 
 
 		 140 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  19.17 
 
 		 128 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  27.03 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  24.39 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>