121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3494 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  99.28 
 
 		 139 aa  280  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  77.37 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  66.18 
 
 		 139 aa  199  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  40 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  42.86 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  36.26 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  35.29 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  38.57 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  34.45 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  33.9 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32.14 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32.14 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  38.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  36 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  26.62 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  43.06 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  29.7 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.51 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  31.43 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  26.13 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  30.4 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  36.05 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  37.21 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  24.19 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  28.71 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  23.96 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  24.83 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  23.77 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  22.95 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  32.35 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  27.78 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  26.55 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  22.95 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  27.14 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  22.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  22.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  22.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  22.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  22.13 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  21.01 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  24.3 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>