106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0214 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  58.54 
 
 		 123 aa  167  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  59.84 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  43.9 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  49.59 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  46.67 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  46.61 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  47.32 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  40.71 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  41.23 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  35.29 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  33.91 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  29.92 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  34.91 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  31.9 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.51 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  28.23 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  27.97 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.67 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  30 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  25.21 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  31.36 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  25.62 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  25.62 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  29.66 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  27.59 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  26.45 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  29.17 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  25.64 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  25.98 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  26.81 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  27.47 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  29.81 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  27.47 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  25.98 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  23.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  26.19 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 122 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  25.86 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  25.86 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  24.35 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  24.19 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  24.19 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  23.93 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  23.81 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  25 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  26.04 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  29.11 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  28 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  27.55 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  23.2 
 
 		 139 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  27.03 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  26.37 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  26.09 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  28.75 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  30.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>