131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3721 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  62.81 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  58.68 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  58.33 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  48.33 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  49.15 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  44.54 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  31.15 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  36.46 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  26.61 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  33.75 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  30.77 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  24.35 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  39.53 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.97 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  29.66 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  23.48 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  23.48 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  25.69 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  25.64 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  27.97 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.73 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  27.87 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  40.3 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  35.48 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  29.75 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  36.56 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  33.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  24.37 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  26.67 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  30.09 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  25.86 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  26.27 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  23.39 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  26.89 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  21.43 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  21.43 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  36.99 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  24.11 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  23.93 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  23.64 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  18.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  21.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  28.21 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  18.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  18.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  24.35 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  28.95 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  23.81 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>