125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5343 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  98.43 
 
 		 166 aa  253  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  97.64 
 
 		 128 aa  229  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  96.85 
 
 		 153 aa  228  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  73.28 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  46.96 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  48.72 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  45.83 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  44.35 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  50.46 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  44.83 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  45.61 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  42.86 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  41.13 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  40.5 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  45.19 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  40.5 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  44.07 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  46.03 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  41.53 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  42.31 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  41.38 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  41.07 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  43.55 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  39.66 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  35.77 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  44.19 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  39.82 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  40 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  38.05 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  40.8 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  39.29 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  35.65 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  37.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  29.69 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  29.27 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  34.34 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  31.71 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  32.17 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  34.18 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  34.18 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  30.38 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  28.75 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  35.44 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  35.44 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  30.4 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  26.02 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  28.44 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.6 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  29.11 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  34.94 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>