138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2606 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  81.42 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  41.94 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  43.59 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  47.57 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  39.82 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  46.23 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  44.64 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  41.44 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  44.04 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  41.9 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  46.15 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  42.97 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  41.67 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  37.93 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  37.61 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  39.6 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  43.36 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  37.9 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  42.42 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  36 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  36 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  43.4 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  41.74 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  38.79 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  35.4 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  40.23 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  42.11 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  36.99 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  44.16 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  34.94 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  44.74 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  35.29 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  32.14 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  32 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  27.47 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  31.3 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  36.78 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  31.82 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.67 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  31.62 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  30.63 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  30.68 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  38.46 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  23.85 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  23.85 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  32.95 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  30.97 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  32.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  30.56 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  36.47 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  38.75 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  38.82 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  36.61 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>