122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0951 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  78.1 
 
 		 107 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  65.83 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  63.48 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  59.48 
 
 		 120 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  55.86 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  56.41 
 
 		 144 aa  124  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  50 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  53.39 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  49.57 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  49.11 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  46.67 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 182 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  46.61 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  39.82 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  39.82 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  51.96 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  44.07 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  38.94 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  42.48 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  46.72 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  41.38 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  43.31 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  44.25 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  45.13 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  45.87 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  44.25 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  37.29 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  39.82 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  42.16 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  42.11 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  36.75 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  37.04 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  50 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  39.64 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  43.06 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  43.06 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  40.24 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  34.21 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  39.44 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  37.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  41.79 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  36.25 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  35.8 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  36.36 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  32.94 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  31.03 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  35 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  31.03 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.59 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  40.74 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  39.19 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  29.59 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  34.85 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  27.63 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  29.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  29.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>