133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0684 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  65.83 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  68.1 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  63.03 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  66.97 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  62.07 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  54.96 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  50.38 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  49.6 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  49.62 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  50.42 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  55.66 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  51.69 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  52.14 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  41.54 
 
 		 131 aa  94  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  48.76 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  48.8 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  39.17 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  49.12 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  41.53 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  46.61 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  47.01 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  43.59 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  40.68 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  44.34 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  42.97 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  42.97 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  46.15 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  36.59 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  40.32 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  41.59 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  39.66 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  37.7 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  38.14 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  40.74 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  41.18 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  41.12 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  31.25 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  38.27 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  41.77 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  41.56 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  34.4 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  35.14 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  38.27 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  34.71 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  26.4 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  36.36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  27.84 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  32 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  24.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  35.62 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  26.89 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>