134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2916 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  80 
 
 		 120 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  63.48 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  68.1 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  61.4 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  65.05 
 
 		 107 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  64.35 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  57.72 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  60.78 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  56.76 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  56.48 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  48.78 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  59 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  59 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  59 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  59 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  59 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  53.04 
 
 		 132 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  53.21 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  52.68 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  45.95 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  51.75 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  46.02 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  46.73 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  46.28 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  42.59 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  42.06 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  42.37 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  46.55 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  44.14 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  44.14 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  46.46 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 121 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 121 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  43.48 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  40.57 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  37.3 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  41.67 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  38.46 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  36.75 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2233  CopY family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  40.79 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5280  CopY family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219064  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  42.42 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  42.31 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  36.75 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  35.66 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  30.43 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  29.57 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  35.09 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  43.04 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  35.09 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  38.16 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  27.83 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  38.89 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  30.43 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  31.3 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  38.89 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  27.88 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  29.73 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>