81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4391 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4391  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 133 aa  263  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4098  CopY family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.088589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0290  penicillinase repressor  47.54 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.837655  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  39.84 
 
 		 205 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  36.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  42.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1351  transcriptional repressor, CopY family protein  35.45 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.204472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  33.61 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  35.04 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  32.52 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  33.67 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.75 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  37.29 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  28.15 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  36.73 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  40.96 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  27.64 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  39.47 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  25.95 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  34.51 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  29.36 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  38.64 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  32.76 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  36.61 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  30.77 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  36.61 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0182  CopY family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  33.04 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  26.02 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  28.45 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  32.95 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  24.39 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  32.46 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  34.48 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  31.11 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  34.48 
 
 		 107 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>